رویترز در مقاله‌ای تحلیلی نوشته است که حمله غافلگیرکننده اسرائیل به تأسیسات هسته‌ای ایران، در حالی که به‌ظاهر برای کند کردن روند پیشرفت برنامه اتمی تهران انجام شده، نشانه‌هایی از هدفی بزرگ‌تر را در خود دارد: تلاش برای تضعیف و سرنگونی نظام جمهوری اسلامی.
در جریان این حمله که بامداد جمعه صورت گرفت، نه‌تنها تاسیسات هسته‌ای و کارخانه‌های موشکی بلکه شماری از فرماندهان ارشد نظامی و دانشمندان هسته‌ای جمهوری اسلامی ایران هدف قرار گرفتند؛ اقدامی که به باور کارشناسان، نه‌تنها مشروعیت داخلی حاکمیت جمهوری اسلامی را زیر سؤال می‌برد، بلکه می‌تواند جایگاه آن را در میان متحدان منطقه‌ای نیز تضعیف کند.
مایکل سینگ، کارشناس مؤسسه واشنگتن و مقام سابق دولت بوش، گفت: «یکی از اهداف احتمالی اسرائیل، امید به تغییر رژیم در ایران است. آن‌ها احتمالاً می‌خواهند مردم ایران برخیزند.»
در همین راستا، بنیامین نتانیاهو نخست‌وزیر اسرائیل در پیامی ویدیویی پس از آغاز حملات، مستقیماً خطاب به مردم ایران گفت: «باور دارم روز آزادی شما نزدیک است. و در آن زمان، دوستی کهن میان دو ملت ما شکوفا خواهد شد.»
با این حال، تحلیل‌گران هشدار می‌دهند که با توجه به دهه‌ها دشمنی عمیق میان جمهوری اسلامی و اسرائیل، حتی در میان مردم عادی ایران، بسیج افکار عمومی برای تغییر رژیم بعید به نظر می‌رسد. سینگ همچنین تأکید کرد که هیچ‌کسی نمی‌داند چه شرایطی می‌تواند به شکل‌گیری یک اپوزیسیون مؤثر در ایران منجر شود.
در ادامه این عملیات بی‌سابقه، اسرائیل تأکید کرده که این تنها مرحله اول بوده و حملات ادامه خواهد داشت. با این حال، مقامات اسرائیلی نیز اذعان دارند که نابودسازی کامل برنامه هسته‌ای ایران از طریق حمله نظامی ممکن نیست.
تزاچی هانگبی، مشاور امنیت ملی اسرائیل، گفت: «راهی برای از بین بردن کامل برنامه هسته‌ای از طریق نظامی وجود ندارد؛ اما این اقدامات می‌تواند شرایط را برای یک توافق با آمریکا مهیا کند.»
برخی کارشناسان معتقدند که حمله به فرماندهان نظامی جمهوری اسلامی ایران می‌تواند ساختار امنیتی کشور را به لرزه درآورد. سیما شاین، تحلیل‌گر سابق موساد، گفت: «این افراد سال‌ها در موقعیت‌های کلیدی بودند و نقش مهمی در ثبات امنیتی رژیم داشتند.»
